Microbioma Intestinal

No Lemos, a avaliação considera uma base de referência da microbiota de brasileiros, oferecendo uma leitura mais alinhada ao paciente brasileiro e mais útil para a individualização da conduta pelo profissional de saúde.

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O que este exame revela?

Seu intestino não é apenas um órgão de digestão. Ele abriga um ecossistema vivo, formado por trilhões de microrganismos que interagem diariamente com a alimentação, a imunidade, o metabolismo, a inflamação e a saúde intestinal.

Esse ecossistema é chamado de microbioma intestinal.

Quando a microbiota está em equilíbrio, ela contribui para a produção de metabólitos importantes, ajuda na proteção da barreira intestinal, participa da digestão de componentes da dieta e influencia a comunicação entre o intestino e outros sistemas do corpo.

Mas quando esse equilíbrio se perde, pode surgir um quadro chamado disbiose. A disbiose não significa apenas “ter bactérias ruins”. Ela pode envolver baixa diversidade, redução de microrganismos importantes, aumento excessivo de alguns grupos ou um padrão de microbiota pouco compatível com o contexto clínico do paciente.

Por isso, avaliar o microbioma pode ser uma ferramenta importante para entender melhor o ambiente intestinal e orientar estratégias mais individualizadas.

O diferencial da avaliação do microbioma pelo Lemos está na interpretação com referência baseada na população brasileira.

Esse cuidado é importante porque a microbiota intestinal não é igual em todas as populações. Alimentação, hábitos de vida, ambiente, cultura alimentar, uso de medicamentos e características populacionais influenciam quais microrganismos são mais esperados em determinado grupo.

Um exemplo simples ajuda a entender: na diarreia do viajante, muitas vezes o problema não está apenas em uma bactéria isolada, mas no contato com microrganismos e padrões ambientais diferentes daqueles aos quais a microbiota da pessoa está adaptada.

Com o microbioma acontece algo parecido na interpretação: um padrão considerado comum em uma população pode não representar o mesmo equilíbrio em outra. Por isso, avaliar o exame de um paciente brasileiro com uma referência mais próxima da realidade brasileira torna a análise mais coerente e reduz o risco de conclusões pouco compatíveis com o nosso contexto.

No Lemos, a avaliação considera uma base de referência da microbiota de brasileiros, oferecendo uma leitura mais alinhada ao paciente brasileiro e mais útil para a individualização da conduta pelo profissional de saúde.

A avaliação do microbioma pode ser realizada por duas metodologias, que respondem a perguntas diferentes e serão detalhadas a seguir

Dentro da avaliação do microbioma, o 16S é a metodologia voltada principalmente para o estudo das bactérias intestinais.

Por meio de sequenciamento genético, o exame identifica os principais grupos bacterianos presentes nas fezes e mostra como eles estão distribuídos no ecossistema intestinal.

Na prática, ajuda a entender se a microbiota apresenta boa diversidade, se há sinais de disbiose e se alguns grupos bacterianos aparecem reduzidos ou aumentados em relação ao esperado.

Dentro da avaliação do microbioma, o Shotgun é uma metodologia mais ampla e detalhada.

Enquanto o 16S é direcionado principalmente ao perfil bacteriano, o Shotgun analisa de forma mais profunda o material genético presente na amostra fecal. Isso permite avaliar não apenas quais microrganismos estão presentes, mas também quais funções esse microbioma pode ter potencialmente.

Em outras palavras, o Shotgun ajuda a aproximar duas perguntas importantes:

  • Quem está presente no intestino?

  • E o que esse microbioma pode estar fazendo?

Diferenciais do Microbioma por Shotgun

  • Avaliação mais abrangente do microbioma intestinal.

  • Identificação de bactérias, fungos, vírus e arqueias, conforme a análise realizada.

  • Maior detalhamento dos microrganismos presentes na amostra.

  • Avaliação do potencial funcional da microbiota.

  • Entrega de assinatura bacteriana relacionada à histamina.

  • Entrega de assinatura bacteriana relacionada à beta-glucuronidase.

  • Apoio à individualização da conduta em casos que exigem investigação mais profunda.

  • Possibilidade de integração com outros marcadores intestinais, como COPROMAX, ácidos graxos de cadeia curta, aminas biogênicas, histamina fecal, beta-glucuronidase fecal, pH fecal, elastase fecal-1, zonulina, calprotectina e IgA secretória.


Em que situação cada avaliação pode ser útil?

Pode ser útil quando o profissional deseja investigar o perfil bacteriano intestinal em situações como:

  • Sintomas intestinais persistentes, como gases, distensão abdominal, dor abdominal, constipação, diarreia ou alternância do trânsito intestinal.

  • Suspeita de disbiose intestinal.

  • Uso recente ou recorrente de antibióticos.

  • Dietas muito restritivas, baixa diversidade alimentar ou dificuldade de tolerar fibras.

  • Acompanhamento de estratégias nutricionais ou terapêuticas voltadas à modulação da microbiota.

  • Avaliação complementar em quadros de inflamação intestinal, alteração de mucosa, permeabilidade intestinal, alterações metabólicas ou sintomas relacionados ao eixo intestino–cérebro.


Pode ser útil quando o profissional deseja uma investigação mais aprofundada do microbioma intestinal, especialmente em situações como:

  • Sintomas intestinais persistentes ou complexos.

  • Suspeita de disbiose com necessidade de maior detalhamento.

  • Investigação ampliada de bactérias, fungos, vírus e arqueias no contexto do microbioma.

  • Suspeita de alteração funcional da microbiota, como produção aumentada ou reduzida de determinados metabólitos.

  • Avaliação de perfis associados à produção de histamina ou à atividade de beta-glucuronidase.

  • Histórico de uso recorrente de antibióticos, antimicrobianos ou quadros de microbiota muito alterada.

  • Acompanhamento de estratégias nutricionais ou terapêuticas voltadas à modulação mais precisa da microbiota.

  • Avaliação complementar em quadros intestinais, metabólicos, inflamatórios, imunológicos, hormonais ou relacionados ao eixo intestino–cérebro, sempre dentro do contexto clínico.

O que cada análise ajuda a responder?

  • A microbiota apresenta boa diversidade bacteriana?

  • Há sinais de disbiose?

  • Existem grupos bacterianos reduzidos ou aumentados de forma relevante?

  • O padrão bacteriano pode estar relacionado a gases, distensão, constipação ou diarreia?

  • A alimentação habitual parece favorecer um microbioma mais diverso e equilibrado?

  • O resultado pode ajudar a orientar estratégias como fibras, prebióticos, probióticos, polifenóis ou outros recursos de modulação intestinal?


  • Quais microrganismos estão presentes além das bactérias?

  • Há presença relevante de fungos, vírus ou arqueias no microbioma?

  • A microbiota apresenta sinais de disbiose?

  • Existem microrganismos reduzidos ou aumentados de forma relevante?

  • O perfil bacteriano apresenta assinatura associada à produção de histamina?

  • O perfil bacteriano apresenta assinatura associada à beta-glucuronidase?

  • O microbioma mostra potencial funcional que pode ajudar a entender sintomas, inflamação, metabolismo, hormônios ou resposta a estratégias terapêuticas?

  • O resultado pode auxiliar na escolha de condutas mais direcionadas para modulação da microbiota?


Observações Importantes

O Microbioma por 16S avalia principalmente bactérias. Ele é indicado quando o objetivo é conhecer o perfil bacteriano intestinal.

Quando a investigação precisa incluir fungos, vírus, arqueias ou informações funcionais mais detalhadas do microbioma, pode ser necessário considerar o Microbioma por Shotgun, conforme o objetivo clínico e a orientação do profissional de saúde.

O resultado do 16S deve ser interpretado junto aos sintomas, dieta, trânsito intestinal, uso de medicamentos, histórico clínico e outros exames disponíveis.


O Microbioma por Shotgun oferece uma análise mais ampla e detalhada do microbioma, mas seu resultado não deve ser interpretado de forma isolada.

A presença de um microrganismo, gene ou assinatura funcional não significa, automaticamente, que aquela função esteja ocorrendo em excesso ou causando sintomas. O exame mostra um potencial associado ao perfil do microbioma.

Por isso, quando houver suspeita clínica, a interpretação pode precisar de marcadores complementares. Por exemplo: uma assinatura bacteriana relacionada à histamina pode ser melhor investigada com histamina fecal e aminas biogênicas; uma assinatura relacionada à beta-glucuronidase pode ser complementada com beta-glucuronidase fecal.

O Shotgun é especialmente útil quando o profissional precisa de uma visão mais profunda do ecossistema intestinal e de suas possíveis funções, integrando microbioma, sintomas, dieta, trânsito intestinal e outros exames.


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